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***English version follows***

Un poste de maitrise avec un passage au doctorat ou un poste direct de doctorat avec bourse est disponible pour un début en automne 2022.

Titre du projet: « Études sur des nouveaux producteurs bactériens des rhamnolipides/glycolipides ».

Date limite interne pour postuler: 15 mai 2022.

Postulez via le lien: https://abdel-mawgoud.com/application-form/

Les rhamnolipides (RL) sont des glycolipides (GL) d’origine microbienne ayant des applications en médecine (comme des agents antimicrobiens, antibiofilms, immunomodulateurs, etc.), en agro-alimentaire et phytosanitaire, en bioremédiation, comme détergents et dans les industries pétrolières (lire plus).

Nous avons identifié récemment, par des outils bio-informatiques, plus que 70 nouveaux producteurs potentiels des RL/GL (lire plus). Nous voulons maintenant valider ces producteurs et identifier les RL/GL produit par ces bactéries. Il s’agit alors des cultivations de ces bactéries, d’optimiser les milieux de culture pour une meilleure production de RL/GL, de purifier et d’identifier les structures des molécules des RL/GL produits. De plus, les propriétés physicochimiques des RL/GL ainsi que leurs activités biologiques seront caractérisées.

Ce projet requière principalement une connaissance de microbiologie, mais aussi de biochimie, et de chimie. Il s’agit de montage des milieux nutritifs, d’optimisation des milieux en utilisant des approches statistiques et la conception expérimentale. La purification des RL/GL sera effectué en utilisant différente méthodes d’extraction et purification basées surtout sur la chromatographie. L’analyse des RL/GL sera effectué en utilisant des techniques analytiques avancées telles que la GC-FID/MS, la LC-MS à haute résolution et précision pour la détection et la quantification des molécules cibles. Les structures chimiques seront confirmées en collaboration avec des analystes d’RMN.. La caractérisation des propriétés physicochimiques (ex. les propriétés détergentes) et des activités biologiques (antimicrobiennes et anticancéreuses) sera effectuée par des méthodes variées selon la nature des molécules identifiées. 

Admissibilité : Nous recherchons des titulaires d’un baccalauréat ou d’une maîtrise hautement motivé.e.s et compétiti.f.ve.s ayant une formation dans au moins trois des domaines suivants :

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A MSc position with a passage to PhD or a direct PhD position with scholarship is available for a start as early as Autumn 2022.

Title of the project: “Studies on new bacterial producers of rhamnolipids/glycolipids”

Deadline for application: April 15, 2022.

Rhamnolipids (RL) are glycolipids (GL) of microbial origin with applications in medicine (as antimicrobial agents, antibiofilms, immunomodulators, etc.), in agro-food and phytosanitary, in bioremediation, as detergents and in oil industries (read more).

We have recently identified, by bioinformatics tools, more than 70 new potential producers of RL/GL (read more). We now aim at validating these producers and identify their produced RL/GL. In this project, these bacteria will be cultivated, their culture media will be optimized for maximum production of RL/GL, their produced RL/GL will be purified and their structures will be identified. In addition, the physicochemical properties of RL/GL as well as their biological activities will be characterized.

This project mainly requires a knowledge of microbiology, but also of biochemistry, and chemistry. The work of this project involves setting up nutrient media, optimizing them using statistical approaches and experimental design. The purification of RL/GL will be carried out using different extraction and purification methods mainly based on chromatography. RL/GL analysis will be performed using analytical techniques such as GC-FID/MS, LC-MS with high resolution and precision for the detection and quantification of target molecules. Definitive chemical structures will be confirmed in collaboration with NMR analysts. The characterization of physicochemical properties (eg. detergent properties) and biological activities (antimicrobial and anticancer) will be carried out by various methods. 

Admissibility: We are seeking highly motivated and competitive BSc or MSc degree holders with backgrounds in at least four of the following domains: