Réunion mensuelle du SB Club ce 25 mars 2024
- Posté par : Ahmad Saleh
- 20 mars 2024
- Sans commentaire
Nous tenons à vous informer que la réunion mensuelle en ligne de Club de biologie synthétique (club SB) aura lieu ce lundi 25 mars 2024 à 12h00 (EST). S'il te plaît, Cliquez ici pour vous inscrire après quoi vous recevrez le lien de la rencontre (zoom).
Titre: "Un voyage dans l'optimisation des outils d'édition du génome basés sur CRISPR-Cas9 pour Yarrowia lipolytica"
Présentateur: Ahmad Saleh, professeur agrégé à l'Université Laval, chercheur principal au Laboratoire de Biologie Synthétique Abdel-Mawgoud et Directeur du Centre de recherche PROTEO-ULaval
Temps: lundi 25 mars 2024 à 12h00 (EST).
Endroit: En ligne (via Zoom). Le lien zoom de la rencontre vous est fourni par mail après votre inscription. Cliquez ici enregistrer.
Résumé: Yarrowia lipolytica est une levure oléagineuse importante utilisée dans la production de produits chimiques spécialisés et qui présente un grand potentiel pour d'autres applications dans la biotechnologie des lipides. Exploiter tout le potentiel de Y. lipolytica est cependant limitée par sa récalcitrance inhérente aux manipulations génétiques traditionnelles. Les méthodes actuelles basées sur CRISPR/Cas9 ont permis de grands progrès dans l'édition du génome de cette levure, mais elles présentaient des limites en termes de nombre de cibles génomiques modifiables ainsi que d'efficacité avec lesquelles elles peuvent être éditées. Nous avons encore amélioré le protocole d'édition CRISPR-Cas9 en optimisant les cassettes d'expression de gRNA et Cas9. Pour optimiser l'expression de l'ARNg, nous avons utilisé des outils de prédiction de la structure de l'ARN secondaire qui ont guidé notre refonte des fusions ARNt-ARNsg utilisées pour l'expression de l'ARN guide unique (ARNsg). Cela a abouti à une édition du génome CRISPR/cas9 à haute efficacité au niveau de loci chromosomiques qui échouaient à l'édition génétique ou qui étaient auparavant modifiables avec une efficacité très faible et en utilisant des modèles avec des bras d'homologie courts. Pour l'optimisation de l'expression de Cas9, nous avons utilisé des outils de prédiction des éléments promoteurs qui ont permis la réingénierie d'un court TEF promoteur d'une expression génique 5 fois plus élevée que celle actuellement conçue TEF promoteurs. Expression de Cas9 sous le court métrage repensé TEF promoteur a augmenté l’efficacité de l’intégration des gènes. Ces outils optimisés d'édition du génome sont censés améliorer l'ingénierie génétique et métabolique de la levure industrielle, Yarrowia lipolytica.