Liste des publications
Publications (Liste compacte)
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| Article de recherche original | 2023-09 | Protocole de fluorométrie lipidique à base de rouge du Nil et son utilisation pour l'optimisation statistique des lipides des levures oléagineuses | Microbiologie appliquée et biotechnologie | 10.1007/s00253-023-12786-9 | 107 | 7313-7330 | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/10.1007_s00253-023-12786-9-citation.ris | B. Ouellet; Z. Morneau; AM Abdel-Mawgoud | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-47a8c2e219915f821b7c74770dfeb206-ff-s00253-023-12786-9-5.pdf | |
| Article de recherche original | 2023-10 | Une forte expression de Cas9 sous un nouveau promoteur TEF1α tronqué en 3' améliore l'édition du génome chez Yarrowia lipolytica | Recherche actuelle en biotechnologie | 10.1016/j.crbiot.2023.100147 | 6 | 100147 | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/S2590262823000291.ris | B. Ouellet; AM Abdel-Mawgoud | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-5e789f507c2284b283b766e2bd5dfe0c-ff-1-s2.0-S2590262823000291-main.pdf | |
| Article de recherche original | 2022-02 | Identification des producteurs putatifs de rhamnolipides/glycolipides et de leurs transporteurs à l'aide de l'extraction du génome | Recherche actuelle en biotechnologie | 10.1016/j.crbiot.2022.02.002 | 4 | 152-166 | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/S2590262822000077.ris | M. Magri; AM Abdel-Mawgoud | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-c8fd4173478eb550bfe8f97a3a55184e-ff-1-s2.0-S2590262822000077-main.pdf | |
| Article de recherche original | 2020-08 | Amélioration de l'efficacité de l'édition du génome médiée par CRISPR/Cas9 chez Yarrowia lipolytica à l'aide de fusions directes d'ARNt et d'ARNsg | Ingénierie métabolique | 10.1016/j.ymben.2020.07.008 | 62 | 106-115 | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/10.1007_s00253-023-12786-9-citation.ris | A. M. Abdel-Mawgoud; G. Stephanopoulos | ||
| Article de synthèse | 2018-11 | Ingénierie métabolique chez l'hôte Yarrowia lipolytica | Ingénierie métabolique | 10.1016/j.ymben.2018.07.016 | 50 | 192-208 | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/S1096717618302738.ris | AM Abdel-Mawgoud; KA Markham; CM Palmer; N. Liu; G. Stephanopoulos; HS Alper | ||
| Article de synthèse | 2018-03 | Glycolipides simples des microbes : chimie, activité biologique et ingénierie métabolique | Biotechnologie de synthèse et des systèmes | 10.1016/j.synbio.2017.12.001 | 3 | 1 | 45370 | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/S1074552113004195.ris | A. M. Abdel-Mawgoud; G. Stephanopoulos | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-83cd398f6ea755253e6dbe4ef1fca018-ff-1-s2.0-S2405805X17300972-main.pdf |
| Article de recherche original | 2014-01 | Une voie stéréospécifique détourne les intermédiaires de la β-oxydation vers la biosynthèse des biosurfactants rhamnolipidiques | Chimie et biologie (maintenant : biologie chimique cellulaire) | 10.1016/j.chambiol.2013.11.010 | 21 | 1 | 156-164 | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/S1074552113004195.ris | AM Abdel-Mawgoud; F. Lépine; E. Déziel | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-4b11699804aef7f62072232804804eac-ff-1-s2.0-S1074552113004195-main.pdf |
| Article de recherche original | 2013-09 | Méthode de chromatographie liquide haute performance chirale couplée à la spectrométrie de masse en tandem pour l'analyse stéréospécifique des énoyl-coenzyme A hydratases/isomérases | Journal de chromatographie A | 10.1016/j.chroma.2013.07.049 | 1306 | 37-43 | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/S0021967313010935.ris | AM Abdel-Mawgoud; F. Lépine; E. Déziel | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-9d867fc38cb89be5a90f724b40ed6ab7-ff-Abdel-Mawgoud-2013-A-chiral-high-perfor.pdf | |
| Article de recherche original | 2013-03 | Analyse comparative des rhamnolipides issus de nouveaux isolats environnementaux de Pseudomonas aeruginosa | Journal des tensioactifs et détergents | 10.1007/s11743-013-1462-4 | 16 | 673-682 | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/10.1007_s11743-013-1462-4-citation.ris | MG Rikalovic ; AM Abdel-Mawgoud; E. Déziel, G. Dj. Gojgic-Cvijovic ; Z. Nestorovic ; MM Vrvic; IM Karadzic | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-85b79e86637de2b4e329ce3c3431f120-ff-s11743-013-1462-4.pdf | |
| Article de synthèse | 2010-03 | Rhamnolipides : diversité des structures, origines microbiennes et rôles | Microbiologie appliquée et biotechnologie | 10.1007/s00253-010-2498-2 | 86 | 1323–1336 | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/10.1007_s00253-010-2498-2-citation.ris | AM Abdel-Mawgoud; F. Lépine; E. Déziel | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-4f351982a2f8aae68d832bbbba1d534d-ff-s00253-010-2498-2-1.pdf | |
| Article de recherche original | 2008-06 | Caractérisation du rhamnolipide produit par l'isolat Bs20 de Pseudomonas aeruginosa | Biochimie appliquée et biotechnologie | 10.1007/s12010-008-8285-1 | 157 | 329-345 | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/10.1007_s12010-008-8285-1-citation.ris | AM Abdel-Mawgoud; MM Aboulwafa ; NA-H. Hassouna | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-621776cfa9e2d27b53fa65c8858517ab-ff-s12010-008-8285-1.pdf | |
| Article de recherche original | 2008-04 | Caractérisation de la surfactine produite par l'isolat BS5 de Bacillus subtilis | Biochimie appliquée et biotechnologie | 10.1007/s12010-008-8153-z | 150 | 3 | 289-303 | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/10.1007_s12010-008-8153-z-citation.ris | AM Abdel-Mawgoud; MM Aboulwafa ; NA-H. Hassouna | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-49a371e3ad8e70901e5197684e9f3a6a-ff-s12010-008-8153-z.pdf |
| Article de recherche original | 2008-02 | Optimisation de la production de surfactine par l'isolat BS5 de Bacillus subtilis | Biochimie appliquée et biotechnologie | 10.1007/s12010-008-8155-x | 150 | 305-325 | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/10.1007_s12010-008-8155-x-citation.ris | AM Abdel-Mawgoud; MM Aboulwafa ; NA-H. Hassouna | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-d3a63bfe9b746472f827ea1533fd0be8-ff-s12010-008-8155-x.pdf | |
| Article de recherche original | 2007-10 | Production microbienne de tensioactifs : criblage et identification de deux isolats prometteurs et de leurs biosurfactants | Journal égyptien de biotechnologie | 27 | 166-185 | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/citation-screening-of-producers.ris | AM Abdel-Mawgoud; MM Aboulwafa ; NA-H. Hassouna | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-f3e1ed4235a62e095faae9b926d88783-ff-ScreeningBiosurfactant.pdf | ||
| Chapitre du livre | 2014-03 | Chromatographie liquide/spectrométrie de masse pour l'identification et la quantification des rhamnolipides | Méthodes et protocoles pour Pseudomonas. Méthodes en biologie moléculaire | 10.1007/978-1-4939-0473-0_30 | 1149 | 359–373 | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/10.1007_978-1-4939-0473-0_30-citation.ris | AM Abdel-Mawgoud; F. Lépine; E. Déziel | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-51222d686dde946b1795bdf120e7145b-ff-2014ee-Abdel-Mawgoud-Pseudomonas_Methods-and-P.pdf | |
| Chapitre du livre | 2010-09 | Rhamnolipides : détection, analyse, biosynthèse, régulation génétique et bio-ingénierie de la production | Biosurfactants. Monographies de microbiologie | 10.1007/978-3-642-14490-5_2 | 20 | 13–55 | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/10.1007_978-3-642-14490-5_2-citation.ris | AM Abdel-Mawgoud; R. Hausmann ; F. Lépine; MM Müller ; E. Déziel | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-1606a0b92864c94baafc52e95cc4d5ae-ff-Book-Chapter.pdf | |
| Brevet | 2015-06 | Modulation de la voie de bêta-oxydation dans le contrôle de la production de rhamnolipides | Organisation mondiale de la propriété intellectuelle - PCT | 1-83 | AM Abdel-Mawgoud; F. Lépine; E. Déziel | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-786903729285bd23542251a8d50c283a-ff-Patent-combined_opt.pdf | ||||
| Article de recherche original | 2024-02 | Production de biodiesel génétiquement modifié à partir de lipides de levure | Recherche actuelle en biotechnologie | 10.1016/j.crbiot.2024.100189 | 7 | 100189 | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/S2590262824000157.ris | B. Ouellet; AM Abdel-Mawgoud | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/1-s2.0-S2590262824000157-main.pdf |
Publications (Liste graphique)
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Protocole de fluorométrie lipidique à base de rouge du Nil et son utilisation pour l'optimisation statistique des lipides des levures oléagineuses
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Article de recherche original | 2023-09 | 10.1007/s00253-023-12786-9 | Microbiologie appliquée et biotechnologie | 107 | 7313-7330 | Fichier de citation | B. Ouellet; Z. Morneau; AM Abdel-Mawgoud | Les levures lipogènes étant de plus en plus utilisées comme bio-usines de produits oléochimiques, la disponibilité de protocoles efficaces pour la détermination et l'optimisation des titres lipidiques dans ces organismes est nécessaire. Dans cette étude, nous avons optimisé un protocole de fluorométrie lipidique rapide, fiable et à haut débit basé sur le rouge du Nil adapté aux levures oléagineuses et l'avons validé à l'aide de différentes approches, dont la plus importante est l'utilisation de la chromatographie en phase gazeuse couplée à la détection par ionisation de flamme et à la spectrométrie de masse. Ce protocole a été appliqué à l'optimisation des concentrations de chlorure d'ammonium et de glycérol pour atteindre les titres lipidiques les plus élevés dans Rhodotorula toruloides NRRL Y-6987 et Yarrowia lipolytica W29 en utilisant une conception composite centrale de surface de réponse (CCD). Français Les résultats de cette optimisation ont montré que la concentration optimale de chlorure d'ammonium et de glycérol est de 4 et 123 g/L atteignant un rapport C/N de 57 pour R. toruloides, tandis que pour Y. lipolytica, les concentrations sont de 4 et 139 g/L avec un rapport C/N de 61 pour Y. lipolytica. En dehors des C/N de 33 à 74 et de 45 à 75, respectivement, pour R. toruloides et Y. lipolytica, les productions lipidiques diminuent de plus de 10%. Les modèles de régression développés et les courbes de surface de réponse montrent l'importance d'une sélection minutieuse du rapport C/N pour atteindre une production lipidique maximale. | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-672263a211a1f1e2c7919b1c658c7271-ff-lipogenesis.png | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-ff7fab06ddc09e8ca1791bf8cdcdd754-ff-NR-optimzation.png | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-407f2810bf5cb048dd3ba98ebe45083a-ff-CDC.png | <a href="https://www.scimagojr.com/journalsearch.php?q=14957&tip=sid&exact=no" title="SCImago Journal et classement des pays"><img border="0" src="https://www.scimagojr.com/journal_img.php?id=14957" alt="SCImago Journal & Country Rank" /></a> | ||
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Une forte expression de Cas9 sous un nouveau promoteur TEF1α tronqué en 3' améliore l'édition du génome chez Yarrowia lipolytica
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Article de recherche original | 2023-10 | 10.1016/j.crbiot.2023.100147 | Recherche actuelle en biotechnologie | 6 | 100147 | Fichier de citation | B. Ouellet; AM Abdel-Mawgoud | La levure non conventionnelle Yarrowia lipolytica suscite de plus en plus d'intérêt en biotechnologie en tant que bête de somme pour la production de protéines, de lipides et d'autres biomolécules. L'édition génomique spécifique au site est cependant limitée chez cette levure. Bien que cela ait été grandement amélioré par l'adaptation récente d'un protocole d'édition génomique CRISPR-Cas9 pour Y. lipolytica basé sur une fusion tRNA-sgRNA, dans ce dernier protocole, Cas9 est sous le contrôle d'un promoteur hybride synthétique, pUAS1B8-TEF(136) qui est associé à certains inconvénients. Ce promoteur hybride contient des répétitions en tandem qui sont censées provoquer des inconvénients in vivo et in vitro comme le glissement de la polymérase, des réarrangements génétiques aléatoires et des difficultés de clonage. Nous présentons ici un promoteur TEF synthétique nouvellement conçu pour piloter l'expression de Cas9, pTEF(-41–406)-Kozak, qui est une version rationnellement tronquée en 3' du promoteur pTEF(406) tronqué en 5' déjà connu de Y. lipolytica fusionné à une séquence synthétique Kozak. Notre comparaison de la force des promoteurs à l'aide de rapporteurs hrGFP et de RT-qPCR a montré que le promoteur synthétique pTEF(-41–406)-Kozak a une force d'expression équivalente à celle de pTEF(406), mais est au moins 5 fois plus fort que l'hybride pUAS1B8-TEF(136). Le promoteur pTEF(-41–406) a permis une expression élevée de Cas9 et n'a été associé à aucun défaut de croissance. Français De plus, l'expression de Cas9 sous pTEF(-41–406)-Kozak a augmenté l'efficacité d'intégration des gènes jusqu'à 40 % par rapport à celle lorsque Cas9 est exprimé sous pUAS1B8-TEF(136). Le pTEF(-41–406) et le pUAS1B8-TEF(136) ont tous deux eu des performances égales en tant que moteurs de l'expression de Cas9 en ce qui concerne la suppression des gènes, comme démontré à la fois aux niveaux génotypique et phénotypique. Il s'agit de la première étude portant sur la troncature 3' rationnelle du promoteur TEF dans Y. lipolytica sur la base d'une analyse in silico de la séquence et de la structure du promoteur. Cette approche d'ingénierie des promoteurs peut être étendue à l'ingénierie d'autres promoteurs de levure pour générer des pièces de biologie synthétique de petite taille pour une ingénierie pratique des systèmes biologiques. Ce travail fournit une cassette d'expression Cas9 puissante pour une édition du génome médiée par CRISPR-Cas9 plus pratique et plus efficace dans Y. lipolytica, ce qui facilitera l'exploitation de tout le potentiel de cette souche industrielle. | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-3c14da80bd346a8c974249038b88f654-ff-CRISPR-Fig1.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-0763c6676586b9746c75cef4b2b3a40f-ff-CRISPR-Fig2.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-ee9a9934c0fd9b52d228bb01e1b2a666-ff-CRISPR-Fig3.jpg | <a href="https://www.scimagojr.com/journalsearch.php?q=21101039902&tip=sid&exact=no" title="SCImago Journal et classement des pays"><img border="0" src="https://www.scimagojr.com/journal_img.php?id=21101039902" alt="SCImago Journal & Country Rank" /></a> | ||
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Identification des producteurs putatifs de rhamnolipides/glycolipides et de leurs transporteurs à l'aide de l'extraction du génome
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Article de recherche original | 2022-02 | 10.1016/j.crbiot.2022.02.002 | Recherche actuelle en biotechnologie | 4 | 152-166 | Fichier de citation | M. Magri; AM Abdel-Mawgoud | Les rhamnolipides (RL) sont des glycolipides microbiens (GL) présentant des bioactivités et des propriétés physicochimiques intéressantes qui les rendent adaptés à diverses applications médicales et industrielles. La découverte de RL présentant des bioactivités et des propriétés plus intéressantes s'est appuyée sur un criblage laborieux de nouveaux producteurs de RL isolés de l'environnement, et a abouti à l'identification redondante de producteurs et de structures de RL déjà connus. Nous présentons ici une approche d'exploration du génome qui a permis l'identification de 80 espèces productrices de RL (y compris les deux espèces de référence), dont 71 n'avaient pas été signalées auparavant. Les arbres de distance de deux de leurs enzymes biosynthétiques de RL, RhlAB, ont permis l'identification de 11 clades distincts. Une validation expérimentale préliminaire par chromatographie sur couche mince sur un producteur de RL/GL non pathogène, Nevskia soli, a confirmé sa production putative de RL. De plus, cette étude a conduit à la découverte du mécanisme de transport putatif RL impliquant trois protéines transmembranaires dont les gènes codants sont hautement conservés et regroupés avec l'un des groupes de gènes biosynthétiques RL dans la plupart des producteurs RL/GL identifiés dans cette étude. | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-d2eeae187ae2301bce225d330af3889e-ff-Figure1-1-s2.0-S2590262822000077-ga1_lrg.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-c5d9a7f5f4d040bdb394a5747222ac65-ff-Figure2-1-s2.0-S2590262822000077-gr1_lrg.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-6c809b953bf3ed847847e7e8a6efca19-ff-Figure3-1-s2.0-S2590262822000077-gr5.jpg | <a href="https://www.scimagojr.com/journalsearch.php?q=21101039902&tip=sid&exact=no" title="SCImago Journal et classement des pays"><img border="0" src="https://www.scimagojr.com/journal_img.php?id=21101039902" alt="SCImago Journal & Country Rank" /></a> | ||
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Amélioration de l'efficacité de l'édition du génome médiée par CRISPR/Cas9 chez Yarrowia lipolytica à l'aide de fusions directes d'ARNt et d'ARNsg
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Article de recherche original | 2020-08 | 10.1016/j.ymben.2020.07.008 | Ingénierie métabolique | 62 | 106-115 | Fichier de citation | A. M. Abdel-Mawgoud; G. Stephanopoulos | Yarrowia lipolytica est une levure oléagineuse importante actuellement utilisée dans la production de produits chimiques de spécialité et présente un grand potentiel pour d'autres applications en biotechnologie lipidique. L'exploitation de tout le potentiel de Y. lipolytica est cependant limitée par sa réticence inhérente à la manipulation génétique. Contrairement à Saccharomyces cerevisiae, Y. lipolytica est pauvre en réparation de l'ADN par homologie et donc en recombinaison homologue, ce qui limite l'édition de gènes spécifiques au site chez cette levure. Des méthodes basées sur CRISPR/Cas9 récemment développées utilisant des fusions d'ARNt-ARNsg ont réussi à éditer certains loci génomiques chez Y. lipolytica. Néanmoins, la majorité des autres loci testés ont échoué à l'édition ou l'édition a été réalisée mais avec une très faible efficacité en utilisant ces méthodes. En utilisant des outils de prédiction de la structure de l'ARN secondaire, nous avons pu améliorer la conception des fusions d'ARNt-ARNsg utilisées pour l'expression de l'ARN guide unique (ARNsg) dans de telles méthodes. Cela a permis d'obtenir une édition génique CRISPR/cas9 très efficace sur des loci chromosomiques qui échouaient à l'édition génique ou étaient édités avec une efficacité très faible avec les méthodes précédentes. De plus, nous avons caractérisé les performances d'édition génique de nos fusions tRNA-sgRNA nouvellement conçues pour l'intégration et la suppression des gènes chromosomiques. Ainsi, cette étude présente un outil efficace d'édition génique médié par CRISPR/Cas9 pour une ingénierie génétique efficace de Yarrowia lipolytica. | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-5f58d4d6a74a6aa8a4993d4cd3d6213e-ff-Figure-1.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-be8761d3d519ba8e9ed8f52f2d453f2f-ff-Figure-2.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-be19953c5fe47237c605a0daa5b1166a-ff-Figure-7.jpg | <a href="https://www.scimagojr.com/journalsearch.php?q=16339&tip=sid&exact=no" title="SCImago Journal et classement des pays"><img border="0" src="https://www.scimagojr.com/journal_img.php?id=16339" alt="SCImago Journal & Country Rank" /></a> | ||
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Ingénierie métabolique chez l'hôte Yarrowia lipolytica
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Article de synthèse | 2018-11 | 10.1016/j.ymben.2018.07.016 | Ingénierie métabolique | 50 | 192-208 | Fichier de citation | AM Abdel-Mawgoud; KA Markham; CM Palmer; N. Liu; G. Stephanopoulos; HS Alper | La levure oléagineuse non conventionnelle Yarrowia lipolytica émerge rapidement comme un hôte précieux pour la production d'une variété de produits chimiques lipidiques et non lipidiques. Bien que la génétique unique de cet organisme pose certains défis, de nombreux nouveaux outils d'ingénierie métabolique ont émergé pour faciliter une meilleure manipulation génétique chez cet hôte. Cette revue établit un cas pour Y. lipolytica comme hôte d'ingénierie métabolique de premier ordre sur la base de la capacité métabolique innée, des outils synthétiques émergents et des exemples d'ingénierie. Le métabolisme sous-jacent au phénotype d'accumulation des lipides de cette levure ainsi que le flux élevé à travers les précurseurs d'acyl-CoA et le cycle TCA fournissent un environnement métabolique favorable à l'expression de voies hétérologues pertinentes. Ces propriétés permettent à Y. lipolytica d'être conçu avec succès pour la production de produits dérivés de lipides, d'acides organiques, de sucres et d'acétyl-CoA natifs et non natifs. Enfin, cet hôte possède des voies métaboliques uniques permettant la croissance sur une large gamme de sources de carbone, y compris les déchets. L’expansion des sources de carbone, ainsi que l’amélioration des outils, comme souligné ici, ont permis à cet organisme non conventionnel d’agir comme une usine cellulaire de produits chimiques et de carburants précieux. | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-7c78cf875e8187aaeb29ae417f2d4b8f-ff-Figure1.png | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-678ab0c0a15c2fcdb715ed66b94763f5-ff-Figure2.png | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-948c923ee5c7a34793e69c72e5bad091-ff-Figure3.jpg | <a href="https://www.scimagojr.com/journalsearch.php?q=16339&tip=sid&exact=no" title="SCImago Journal et classement des pays"><img border="0" src="https://www.scimagojr.com/journal_img.php?id=16339" alt="SCImago Journal & Country Rank" /></a> | ||
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Glycolipides simples des microbes : chimie, activité biologique et ingénierie métabolique
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Article de synthèse | 2018-03 | 10.1016/j.synbio.2017.12.001 | Biotechnologie de synthèse et des systèmes | 3 | 1 | 45370 | Fichier de citation | A. M. Abdel-Mawgoud; G. Stephanopoulos | Les lipides glycosylés (GL) sont des dérivés lipidiques à valeur ajoutée et à fort potentiel. Outre leurs intéressantes activités de surface qui en font d'excellents détergents écologiques, ils présentent diverses activités biologiques avec des applications biomédicales et cosméceutiques prometteuses. Les glycolipides, en particulier ceux d'origine microbienne, ont des activités antimicrobiennes, anticancéreuses, antiparasitaires et immunomodulatrices intéressantes. Néanmoins, les GL ont difficilement accès au marché en raison de leur coût de production élevé. Nous pensons que l'expérience de l'ingénierie métabolique (EM) des lipides microbiens pour la production de biocarburants peut désormais être exploitée pour une synthèse réussie de GL microbiens pour des applications biomédicales et autres. Cette revue présente les groupes chimiques de GL bactériens et fongiques, leurs activités biologiques, leurs voies de biosynthèse générales et un aperçu des stratégies d'EM pour leur production. | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-9755b120283f44cb8daf6b2be5bd18ec-ff-1-s2.0-S2405805X17300972-gr3_lrg.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-91ad05b6c56b51fccadf01d61e3e5888-ff-1-s2.0-S2405805X17300972-gr4_lrg.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-df85307fdc4bbb70f2c5e8a45d718e09-ff-1-s2.0-S2405805X17300972-gr5.jpg | <a href="https://www.scimagojr.com/journalsearch.php?q=21100832688&tip=sid&exact=no" title="SCImago Journal et classement des pays"><img border="0" src="https://www.scimagojr.com/journal_img.php?id=21100832688" alt="SCImago Journal & Country Rank" /></a> | |
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Une voie stéréospécifique détourne les intermédiaires de la β-oxydation vers la biosynthèse des biosurfactants rhamnolipidiques
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Article de recherche original | 2014-01 | 10.1016/j.chambiol.2013.11.010 | Chimie et biologie (maintenant : biologie chimique cellulaire) | 21 | 1 | 156-164 | Fichier de citation | AM Abdel-Mawgoud; F. Lépine; E. Déziel | Les rhamnolipides sont des molécules tensioactives polyvalentes produites par la bactérie Pseudomonas aeruginosa à partir de précurseurs de L-rhamnose et de R-3-hydroxyalcanoate (C10±2). Le précurseur de R-3-hydroxyalcanoate est supposé être synthétisé de novo. Nous démontrons cependant que la β-oxydation est la source prédominante de ce précurseur. L'inhibition de la β-oxydation diminue fortement la production de rhamnolipides, même en utilisant une source de carbone non acide gras (glycérol). Le traçage isotopique montre que les intermédiaires de β-oxydation sont des précurseurs directs des rhamnolipides. Une étude basée sur des mutants a révélé un opéron codant pour les énoyl-CoA hydratases/isomérases (ECH/I), nommé RhlYZ, impliqué dans la production de rhamnolipides via un rôle axial dans la synthèse des 3-hydroxyalcanoates. In vitro, RhlZ est un R-ECH/I transformant le 2-décénoyl-CoA, un intermédiaire de β-oxydation, en R-3-hydroxydécanoyl-CoA, le précurseur potentiel des rhamnolipides. Il est intéressant de noter que les polyhydroxyalcanoates partagent avec les rhamnolipides le pool de R-3-hydroxyalcanoates générés par RhlYZ, comme le démontrent la diminution des polyhydroxyalcanoates lors de la mutation de rhlYZ et l'augmentation des rhamnolipides chez un mutant déficient en polyhydroxyalcanoates. | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-7c9bfd6bd0507ed2d086f765795ce888-ff-1-s2.0-S1074552113004195-gr2_figure1.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-5c9aea2bdcda49eeea653a946c6e8391-ff-1-s2.0-S1074552113004195-gr4_lrgFigure2.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-1091908230f4b5952fd745f438ada222-ff-1-s2.0-S1074552113004195-gr7-Figure-3.jpg | <a href="https://www.scimagojr.com/journalsearch.php?q=21100456838&tip=sid&exact=no" title="SCImago Journal et classement des pays"><img border="0" src="https://www.scimagojr.com/journal_img.php?id=21100456838" alt="SCImago Journal & Country Rank" /></a> | |
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Méthode de chromatographie liquide haute performance chirale couplée à la spectrométrie de masse en tandem pour l'analyse stéréospécifique des énoyl-coenzyme A hydratases/isomérases
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Article de recherche original | 2013-09 | 10.1016/j.chroma.2013.07.049 | Journal de chromatographie A | 1306 | 37-43 | Fichier de citation | AM Abdel-Mawgoud; F. Lépine; E. Déziel | Les enzymes catalysant l'hydratation stéréospécifique du 2-énoyl-CoA en S- ou R-3-hydroxyacyl-CoA correspondants sont appelées énoyl-CoA hydratases (ECH), où la S-spécifique est appelée ECH-1 et la R-spécifique est appelée ECH-2. Les dosages ECH actuels sont principalement basés sur des méthodes spectrophotométriques. Parmi de nombreuses limitations, ces méthodes ne mesurent pas directement le 3-hydroxyacyl-CoA produit, ni ne permettent de déterminer sa configuration stéréospécifique. Nous avons développé une méthode HPLC chirale couplée à la spectrométrie de masse en tandem (MS) pour l'analyse sensible, directe, stéréospécifique et quantitative des produits de réaction ECH-1/-2, ou R-/S-3-hydroxyalcanoates en général. La méthode est basée sur la réaction du groupe 3-hydroxyle sur le carbone chiral avec l'isocyanate de 3,5-diméthylphényle, créant un dérivé d'uréthane qui est ensuite résolu chiralement sur une colonne HPLC chirale ayant de la cellulose dérivée du carbamate de 3,5-diméthylphényle comme phase stationnaire chirale. Les dérivés d'uréthane résolus sont détectés à l'aide de la spectrométrie de masse en tandem dans le mode d'ionisation par électrospray négatif à surveillance de réactions multiples (MRM) en surveillant l'ion fragment d'acide gras hydroxy libre libéré de son dérivé d'uréthane parent. La méthode résout les énantiomères R-/S des homologues d'acide gras 3-hydroxy allant de C6 à C16. En utilisant cette méthode, l'activité ECH nette présente dans les lysats cellulaires clarifiés de la bactérie Pseudomonas aeruginosa cultivée dans un milieu riche s'est avérée être à la fois de ECH-1 et ECH-2. Il est intéressant de noter que le lysat cellulaire clarifié d'Escherichia coli cultivé également dans un milieu riche a montré principalement une activité ECH-1 (spécifique S). Cette méthode facilitera la quantification et la caractérisation stéréospécifique des ECH, ainsi que le profilage lipidique chiral des métabolites secondaires bactériens contenant des fragments d'acide hydroxyalcanoïque. | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-2cd1d46520966d995340cd00153b0489-ff-Figure-1.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-33da121964d41b1b50d372e99ad36880-ff-Figure-2.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-f7357dc9cae6ea4e42df38aed76c36fd-ff-Figure-3.jpg | <a href="https://www.scimagojr.com/journalsearch.php?q=130000&tip=sid&exact=no" title="SCImago Journal et classement des pays"><img border="0" src="https://www.scimagojr.com/journal_img.php?id=130000" alt="SCImago Journal & Country Rank" /></a> | ||
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Analyse comparative des rhamnolipides issus de nouveaux isolats environnementaux de Pseudomonas aeruginosa
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Article de recherche original | 2013-03 | 10.1007/s11743-013-1462-4 | Journal des tensioactifs et détergents | 16 | 673-682 | Fichier de citation | MG Rikalovic ; AM Abdel-Mawgoud; E. Déziel, G. Dj. Gojgic-Cvijovic ; Z. Nestorovic ; MM Vrvic; IM Karadzic | Français Une analyse comparative des rhamnolipides des isolats environnementaux de Pseudomonas aeruginosa a été entreprise pour évaluer les empreintes digitales des rhamnolipides spécifiques à la souche obtenues dans différentes conditions de croissance. Les isolats environnementaux de P. aeruginosa ont produit des rhamnolipides sur différents types de substrats, y compris des sources bon marché et renouvelables comme l'huile de tournesol provenant de friteuses et les effluents d'huileries de tournesol. Les rhamnolipides ont été surveillés par spectrométrie de masse à interface chromatographie liquide haute performance-ionisation par électrospray, qui a permis une identification et une quantification rapides et fiables des congénères présents. La concentration la plus élevée de rhamnolipides totaux de 3,33 g/l a été obtenue par la souche P. aeruginosa 67, récupérée d'un sol contaminé par du pétrole, et les souches D1 (1,73 g/l) et D2 (1,70 g/l), récupérées de consortiums microbiens naturels provenant d'un sol contaminé par du mazout, cultivés sur de l'huile de tournesol comme source de carbone. Français Les rapports di-/mono-rhamnolipides étaient de l'ordre de 0,90 à 5,39 pour différentes compositions de milieux et de 1,12 à 4,17 pour différentes souches productrices. Les profils de rhamnolipides des mélanges purifiés de toutes les souches testées sont similaires avec une longueur de chaîne de C8 à C12, une abondance prononcée de congénères Rha–C10–C10 et Rha–Rha–C10–C10 et une faible teneur en acides 3-(3-hydroxyalcanoyloxy)-alcanoïques. Les concentrations des congénères majeurs des RL se sont avérées varier légèrement, en fonction de la souche et des conditions de croissance, tandis que les variations des congénères mineurs étaient plus prononcées. Une augmentation statistiquement significative des valeurs de concentration micellaire critique a été observée avec la diminution du rapport entre le rapport mono-/di-rhamnolipides totaux, indiquant que les mono-rhamnolipides commencent à former des micelles à une concentration plus faible que les di-rhamnolipides. | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-1d3c9c3e31783f58eb550761173bdca5-ff-Table-1.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-7e8b85d996e5fb1eebaf3a614d01a77d-ff-Table-2.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-0d37fed8633ba34e9f474844426e1cc6-ff-Table-3.jpg | <a href="https://www.scimagojr.com/journalsearch.php?q=25919&tip=sid&exact=no" title="SCImago Journal et classement des pays"><img border="0" src="https://www.scimagojr.com/journal_img.php?id=25919" alt="SCImago Journal & Country Rank" /></a> | ||
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Rhamnolipides : diversité des structures, origines microbiennes et rôles
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Article de synthèse | 2010-03 | 10.1007/s00253-010-2498-2 | Microbiologie appliquée et biotechnologie | 86 | 1323–1336 | Fichier de citation | AM Abdel-Mawgoud; F. Lépine; E. Déziel | Les rhamnolipides sont des biosurfactants glycolipidiques produits par diverses espèces bactériennes. Ils ont été initialement découverts comme exoproduits du pathogène opportuniste Pseudomonas aeruginosa et décrits comme un mélange de quatre congénères : α-L-rhamnopyranosyl-α-L-rhamnopyranosyl-β-hydroxydecanoyl-β-hydroxydecanoate (Rha-Rha-C10-C10), α-L-rhamnopyranosyl-α-L-rhamnopyranosyl-β-hydroxydecanoate (Rha-Rha-C10), ainsi que leurs congénères mono-rhamnolipidiques Rha-C10-C10 et Rha-C10. Le développement de techniques analytiques plus sensibles a permis de découvrir une grande diversité de congénères et d'homologues de rhamnolipides (environ 60) produits à différentes concentrations par diverses espèces de Pseudomonas et par des bactéries appartenant à d'autres familles, classes ou même phyla. Par exemple, il a été montré que diverses espèces de Burkholderia produisent des rhamnolipides ayant des chaînes alkyles plus longues que celles produites par P. aeruginosa. Chez P. aeruginosa, trois gènes, portés par deux opérons distincts, codent pour les enzymes responsables des étapes finales de la synthèse des rhamnolipides : l'un porte les gènes rhlAB et l'autre rhlC. Des gènes très similaires à rhlA, rhlB et rhlC ont également été trouvés chez diverses espèces de Burkholderia mais regroupés au sein d'un opéron putatif, et il a été montré qu'ils étaient également nécessaires à la production de rhamnolipides. La fonction physiologique exacte de ces métabolites secondaires n'est pas encore claire. La plupart des activités identifiées découlent de l'activité de surface, de la capacité de mouillage, de la détergence et d'autres propriétés amphipathiques de ces molécules. En effet, les rhamnolipides favorisent l'absorption et la biodégradation de substrats peu solubles, agissent comme modulateurs immunitaires et facteurs de virulence, ont des activités antimicrobiennes et sont impliqués dans la motilité de surface et dans le développement de biofilms bactériens. | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-7ed9f5ad32275b10e6606b608c311800-ff-Figure-1.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-91e723be962690d6a24fa4b4f289bf19-ff-Table.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-11c978ab651e0a98df322c3d41bf0f47-ff-Table-2.jpg | <a href="https://www.scimagojr.com/journalsearch.php?q=14957&tip=sid&exact=no" title="SCImago Journal et classement des pays"><img border="0" src="https://www.scimagojr.com/journal_img.php?id=14957" alt="SCImago Journal & Country Rank" /></a> | ||
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Caractérisation du rhamnolipide produit par l'isolat Bs20 de Pseudomonas aeruginosa
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Article de recherche original | 2008-06 | 10.1007/s12010-008-8285-1 | Biochimie appliquée et biotechnologie | 157 | 329-345 | Fichier de citation | AM Abdel-Mawgoud; MM Aboulwafa ; NA-H. Hassouna | Le rhamnolipide produit par l'isolat Bs20 de Pseudomonas aeruginosa est un liquide visqueux, collant, huileux, brun jaunâtre, à l'odeur fruitée. Il a montré une solubilité à un pH aqueux > 4 avec une solubilité optimale à pH 7–7,5 et est librement soluble dans l'acétate d'éthyle. Ce biosurfactant a une activité de surface très élevée car il peut abaisser la tension superficielle de l'eau à 30 mN/m à environ 13,4 mg/L, et il a montré d'excellentes stabilités à des températures élevées (chauffage à 100 °C pendant 1 h et autoclavage à 121 °C pendant 10 min), des salinités (jusqu'à 6% NaCl) et des valeurs de pH (jusqu'à pH 13). Le biosurfactant produit peut être utilisé sous forme brute comme bouillon de culture acellulaire ou contenant des cellules des bactéries cultivées, car les deux préparations ont montré des indices d'émulsification élevés compris entre 59% et 66% contre le kérosène, le diesel et l'huile moteur. Ces caractéristiques font du rhamnolipide d'essai un candidat potentiel pour une utilisation dans la biorestauration de sites contaminés par des hydrocarbures ou dans l'industrie pétrolière. La densitométrie par chromatographie en couche mince haute performance a révélé que le rhamnolipide extrait contenait les deux homologues de rhamnolipide les plus actifs, le rhamnolipide dirhamno dilipidique et le rhamnolipide monorhamno dilipidique à 44% et 56%, respectivement, par rapport à 51% et 29,5%, respectivement, dans une préparation de rhamnolipide standard. La nature et le rapport de ces deux homologues de rhamnolipides se sont avérés dépendre de la souche plutôt que du composant du milieu. | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-1085b795995884aabab5642e58736c1d-ff-Figure1.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-75c303b9bbfa95fc6f046208653d1096-ff-Figure-2.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-1dbea27c9ef163d1062f7ff438888f33-ff-ahmad-rl.jpg | <a href="https://www.scimagojr.com/journalsearch.php?q=110291&tip=sid&exact=no" title="SCImago Journal et classement des pays"><img border="0" src="https://www.scimagojr.com/journal_img.php?id=110291" alt="SCImago Journal & Country Rank" /></a> | ||
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Caractérisation de la surfactine produite par l'isolat BS5 de Bacillus subtilis
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Article de recherche original | 2008-04 | 10.1007/s12010-008-8153-z | Biochimie appliquée et biotechnologie | 150 | 3 | 289-303 | Fichier de citation | AM Abdel-Mawgoud; MM Aboulwafa ; NA-H. Hassouna | La caractérisation physique et chromatographique du biosurfactant de surfactine produit par l'isolat BS5 de Bacillus subtilis a été réalisée pour étudier son potentiel d'application industrielle. L'extrait brut de surfactine d'essai apparaissait comme un résidu amorphe blanc cassé à chamois ressemblant à des flocons avec une mauvaise odeur semblable à celle de la grenade aigre. La surfactine d'essai a montré une solubilité dans une solution aqueuse à pH > 5 avec une solubilité optimale à pH 8-8,5. Elle était également soluble dans des solvants organiques comme l'éthanol, l'acétone, le méthanol, le butanol, le chloroforme et le dichlorométhane. Les cristaux de surfactine apparaissaient rectangulaires avec des coins émoussés et étaient disposés perpendiculairement les uns aux autres formant un signe plus. La surfactine extraite a montré une activité de surface élevée, car elle pouvait abaisser la tension superficielle de l'eau d'environ 70 à 36 mN/m à ~15,6 mg/l. Français De plus, la surfactine d'essai a montré d'excellentes stabilités à des températures élevées (100 °C pendant jusqu'à 1 h et autoclavage à 121 °C pendant 10 min), à des salinités (jusqu'à 6% NaCl) et sur une large plage de pH (5-13). La surfactine d'essai dans les formes surnageante acellulaire ou dans le bouillon de culture brut a montré des indices d'émulsification élevés contre le kérosène (62,5% et 59%, respectivement), le diesel (62,5% et 66%, respectivement) et l'huile moteur (62% et 66%, respectivement). Ces caractéristiques peuvent effectivement faire de la surfactine d'essai, dans ses formes brutes, un candidat potentiel pour l'utilisation dans la biorestauration des sites contaminés par des hydrocarbures ou dans l'industrie pétrolière. La caractérisation chromatographique de la surfactine d'essai, à l'aide de la technique de chromatographie liquide à haute performance, a révélé que la surfactine extraite contenait de nombreuses isoformes, dont six ont été trouvées dans la préparation de surfactine standard (Fluka). Des pics supplémentaires sont apparus dans la surfactine d'essai et non dans la préparation standard. Ces pics peuvent correspondre à de nouvelles isoformes de surfactine qui peuvent être présentes dans la surfactine d'essai produite par l'isolat BS5 de B. subtilis. | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-6af8397aca0ef275bc1a4c61d88c08b6-ff-Figure1.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-fc091a80f70cc006810a5a3541d5b5c1-ff-Figure2.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-fbf8c0ceab8d3d66f5f32b990120fc2e-ff-Figure3.jpg | <a href="https://www.scimagojr.com/journalsearch.php?q=110291&tip=sid&exact=no" title="SCImago Journal et classement des pays"><img border="0" src="https://www.scimagojr.com/journal_img.php?id=110291" alt="SCImago Journal & Country Rank" /></a> | |
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Optimisation de la production de surfactine par l'isolat BS5 de Bacillus subtilis
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Article de recherche original | 2008-02 | 10.1007/s12010-008-8155-x | Biochimie appliquée et biotechnologie | 150 | 305-325 | Fichier de citation | AM Abdel-Mawgoud; MM Aboulwafa ; NA-H. Hassouna | Bacillus subtilis BS5 est un isolat de sol qui produit un rendement prometteur de surfactant bio dans un milieu de sels minéraux (MSM). Il a été constaté que la croissance cellulaire et la production de surfactine dans le MSM étaient grandement affectées par les conditions environnementales de fermentation et les composants du milieu (sources de carbone et d'azote et minéraux). Les conditions environnementales optimales pour une production élevée de surfactine au niveau du flacon agité se sont avérées être un pH initial légèrement acide (6,5-6,8), une température d'incubation de 30 °C, un pourcentage d'aération volumétrique de 90% et une taille d'inoculum de 2% v/v. Français Pour les composants du milieu, il a été constaté que la source de carbone optimale était la mélasse (160 ml/l), tandis que la source d'azote optimale était NaNO3 (5 g/l) et que les oligo-éléments optimaux étaient ZnSO4·7H2O (0,16 g/l), FeCl3·6H2O (0,27 g/l) et MnSO4·H2O (0,017 g/l). Un MSM modifié (MSM de mélasse), combinant les composants optimaux du milieu, a été formulé et a entraîné une multiplication par trois de la productivité de surfactine qui a atteint 1,12 g/l. Aucun plasmide n'a pu être détecté dans l'isolat testé, révélant que la production de biosurfactant par l'isolat BS5 de B. subtilis est médiée par les chromosomes mais pas par les plasmides. | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-42806ff49d7aad23e519b0c894193c17-ff-Figure1.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-0ec7d075fb3468f98bd8a84eed65ad10-ff-Figure2.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-2161e9b431a4a0777325b598898b430e-ff-Figure3.jpg | <a href="https://www.scimagojr.com/journalsearch.php?q=110291&tip=sid&exact=no" title="SCImago Journal et classement des pays"><img border="0" src="https://www.scimagojr.com/journal_img.php?id=110291" alt="SCImago Journal & Country Rank" /></a> | ||
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Production microbienne de tensioactifs : criblage et identification de deux isolats prometteurs et de leurs biosurfactants
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Article de recherche original | 2007-10 | Journal égyptien de biotechnologie | 27 | 166-185 | Fichier de citation | AM Abdel-Mawgoud; MM Aboulwafa ; NA-H. Hassouna | Français La production microbienne de tensioactifs a été testée sur 1945 isolats bactériens. Les isolats testés ont été récupérés à partir de 30 échantillons de sol contaminés par des produits pétroliers, des produits pétroliers et du fer ou non contaminés. La production de biosurfactants a été testée à l'aide d'un protocole de criblage en 3 phases. Le criblage primaire a été effectué par mesure de la tension superficielle à l'aide du test qualitatif de chute-effondrement (DCT) qui a abouti à la découverte de 28 isolats à forte production de biosurfactants. Ces isolats ont été soumis à un criblage secondaire à l'aide d'une méthode de micro-essai semi-quantitatif pour les tensioactifs (test d'étalement d'huile, OST) qui a abouti à la sélection de 16 isolats (sur 28 producteurs élevés de biosurfactants) qui ont enregistré les scores les plus élevés. Un criblage tertiaire a été effectué sur les 16 isolats à l'aide d'un tensiomètre annulaire du Nouy pour une mesure quantitative plus sensible de la tension superficielle. Sur les 16 isolats testés lors du criblage tertiaire ; Un isolat Gram positif BS5, identifié comme Bacillus subtilis, et un isolat Gram négatif BS20, identifié comme Pseudomonas aeruginosa, ont chacun montré la productivité de biosurfactant la plus élevée par rapport aux autres membres de son groupe Gram. Le biosurfactant produit par l'isolat B. subtilis BS5 dans un milieu aux sels minéraux (MSM) a été identifié comme étant de la surfactine, tandis que celui produit par l'isolat P. aeruginosa BS20 a été identifié comme étant du rhamnolipide. L'analyse TLC a révélé que la surfactine présentait une tache séparée avec une valeur Rf de 0,8, tandis que le biosurfactant rhamnolipide présentait deux taches séparées ayant des valeurs Rf de 0,4 et 0,68. | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-f886df9501cb4b7dd6402b592ae6c882-ff-Figure1.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-5d2b8f1ddfedf183a19820e5080464b3-ff-Figure2.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-9df317f9ccb80d6f69867d3d6659d3cb-ff-Figure3.jpg | ||||
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Chromatographie liquide/spectrométrie de masse pour l'identification et la quantification des rhamnolipides
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Chapitre du livre | 2014-03 | 10.1007/978-1-4939-0473-0_30 | Méthodes et protocoles pour Pseudomonas. Méthodes en biologie moléculaire | 1149 | 359–373 | Fichier de citation | AM Abdel-Mawgoud; F. Lépine; E. Déziel | Les rhamnolipides (RL) sont des glycolipides tensioactifs produits par Pseudomonas aeruginosa. Ils sont toujours produits par cette bactérie sous forme d'un mélange complexe de congénères, chacun composé d'une ou deux molécules de rhamnose liées à un dimère d'acides gras 3-hydroxy avec une longueur de chaîne de 8 à 12 carbones. L'intérêt croissant pour les RL entraîne le besoin de méthodes analytiques efficaces pour caractériser ces mélanges de molécules. La chromatographie liquide haute performance (HPLC) couplée à la spectrométrie de masse en tandem (MS/MS) est une méthode très précise et relativement à haut débit pour l'identification de chaque congénère et leur quantification dans les cultures bactériennes. L'utilisation de RL marqués au 13C comme étalons internes peut encore améliorer la précision de la quantification. Les expériences de dissociation induite par collision (CID) par MS/MS sont un outil puissant pour la détection et l'identification des variations structurelles des RL produits par diverses souches de Pseudomonas ou par une souche spécifique dans différentes conditions de culture. Le CID permet même la discrimination entre des isomères présentant des variations structurelles subtiles, comme le Rha-C8-C10 et le Rha-C10-C8, qui sont presque indissociables chromatographiquement. Nous présentons ici les protocoles détaillés pour l'analyse HPLC/MS et HPLC/MS/MS des RL et de leurs précurseurs lipidiques, les acides 3-(3-hydroxyalcanoyloxy)alcanoïques (HAA), directement dans les surnageants de culture bactérienne. | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-509fa53077b55ee2024398d08ecc3a02-ff-RL-structures.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-280c72745a8b2d9b3ebcbc624fc81058-ff-Figure2.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-992e12512ce9b4ba7453d334c7568db2-ff-Figure3.jpg | <a href="https://www.scimagojr.com/journalsearch.php?q=12196&tip=sid&exact=no" title="SCImago Journal et classement des pays"><img border="0" src="https://www.scimagojr.com/journal_img.php?id=12196" alt="SCImago Journal & Country Rank" /></a> | ||
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Rhamnolipides : détection, analyse, biosynthèse, régulation génétique et bio-ingénierie de la production
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Chapitre du livre | 2010-09 | 10.1007/978-3-642-14490-5_2 | Biosurfactants. Monographies de microbiologie | 20 | 13–55 | Fichier de citation | AM Abdel-Mawgoud; R. Hausmann ; F. Lépine; MM Müller ; E. Déziel | En tant que produits biotechnologiques prometteurs, les rhamnolipides (RL) sont les biosurfactants les plus étudiés. Au fil des ans, des efforts importants ont été déployés et un ensemble de techniques a été développé pour l'isolement de souches bactériennes productrices et la caractérisation d'une grande variété d'homologues et de congénères de RL. Les recherches sur la production de RL par le producteur le plus connu, le pathogène opportuniste Pseudomonas aeruginosa, ont montré que la production de RL se déroule par biosynthèse de novo de précurseurs. Au cours des 15 dernières années, les détails génétiques sous-jacents à la production de RL chez P. aeruginosa ont été en grande partie élucidés, révélant un mécanisme de régulation complexe contrôlé par des voies de détection de quorum de communication intercellulaire. Un certain nombre de facteurs nutritionnels et de culture affectant la productivité des RL ont également été identifiés, tandis que l'utilisation de nombreux substrats bruts abordables et renouvelables a été décrite pour optimiser la production. Des approches multidisciplinaires sont de plus en plus adoptées pour développer des méthodes de production sûre, rentable et hautement efficace de RL à l'échelle industrielle. | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-636a4718c110dd50c287c48c87f7be15-ff-Figure1.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-4e86a90aaddca6dc6ba4dc191017f71b-ff-Figure2.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-9bcddc864249e3106a859d787af043e8-ff-Figure3.jpg | |||
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<a href="https://patents.google.com/patent/WO2015085411A1/en" target="_blank">Modulation de la voie de bêta-oxydation dans le contrôle de la production de rhamnolipides</a>
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Brevet | 2015-06 | Organisation mondiale de la propriété intellectuelle - PCT | 1-83 | AM Abdel-Mawgoud; F. Lépine; E. Déziel | L'invention concerne de nouveaux procédés et agents permettant de moduler la production de rhamnolipides (RL) par un micro-organisme, par la modulation de l'expression et/ou de l'activité d'énoyl-CoA hydratases/isomérases spécifiques de R (ECH/I). L'invention concerne également des essais permettant d'identifier des agents pouvant être utiles pour moduler la production de RL par un micro-organisme. | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-d1b59161795e1f49cd4894e6c5fbe29b-ff-Figure2.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-5576dd4f4b3bc8d358f6504449a77f36-ff-Figure3.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-2c6977f4e18dec8d834bf251ad2f6f04-ff-Figure4.jpg | ||||||
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Production de biodiesel génétiquement modifié à partir de lipides de levure
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Article de recherche original | 2024-02 | 10.1016/j.crbiot.2024.100189 | Recherche actuelle en biotechnologie | 7 | 100189 | Fichier de citation | B. Ouellet; AM Abdel-Mawgoud | Les biodiesels constituent une classe croissante de carburants dans le monde, qui tend de plus en plus vers une énergie plus écologique et durable. Malgré leurs avantages, les biodiesels ont des propriétés d'écoulement à froid limitées et des émissions de NOx plus importantes, qui sont principalement attribuées à la composition chimique de leurs matières premières pétrolières. Cette étude présente une nouvelle approche pour produire du biodiesel génétiquement modifié (GEB) à partir d'huiles de levure oléagineuse génétiquement manipulées, qui seront utilisées pour la production de biodiesels aux propriétés et performances améliorées. En utilisant un design composite central factoriel complet, la meilleure composition chimique d'un biodiesel optimal a été prédite. Ensuite, des mutants simples et combinés MFE1, PEX10 et POX2 de la levure oléagineuse Yarrowia lipolytica ont été construits et ont montré des profils lipidiques intéressants dont le biodiesel devrait avoir de meilleures propriétés d'écoulement à froid. Ces mutants ont également montré des titres lipidiques 2 à 3 fois plus élevés que la souche mère. Cette étude fournit une stratégie de génie génétique pour la conception sur mesure des propriétés et des performances du biodiesel. De plus, il fournit des solutions permettant au biodiesel d’être potentiellement utilisé comme carburant autonome sans aucun mélange avec du pétrodiesel. | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-7baf625e5f1da32a85723f397f58a2e2-ff-Graphical-abstract.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-a66dc0d76e6b4296d3902d5067a41509-ff-CCD.jpg | https://abdel-mawgoud.com/wp-content/uploads/fluentform/ff-aad2ce23e75ffca4f3d8f245df9d3375-ff-Lipid-profiles.jpg | <a href="https://www.scimagojr.com/journalsearch.php?q=21101039902&tip=sid&exact=no" title="SCImago Journal et classement des pays"><img border="0" src="https://www.scimagojr.com/journal_img.php?id=21101039902" alt="SCImago Journal & Country Rank" /></a> |