Réunion mensuelle du SB Club ce 30 septembre 2024
- Posté par : Ahmad Saleh
- 18 septembre 2024
- Sans commentaire
Nous tenons à vous informer que la réunion mensuelle en ligne de Club de biologie synthétique (club SB) aura lieu ce lundi 30 septembre 2024 à 12h00 (EST). S'il vous plaît, Cliquez ici pour vous inscrire après quoi vous recevrez le lien de la rencontre (zoom).
Titre: "Systèmes d'assemblage Golden Gate pour l'ingénierie rapide des génomes de bactériophages"
Présentateur: Gregory Lohman, professionnel de recherche à Département de recherche de New England Biolabs Division de biologie moléculaire appliquée 240 County Rd. Ipswich, MA 01938
Temps:Lundi 30 septembre 2024 à 12h00 (EST).
Endroit: En ligne (via Zoom). Le lien zoom de la rencontre vous est fourni par mail après votre inscription. Cliquez ici enregistrer.
Résumé: La conception d'assemblage optimisée des données applique des mesures complètes de fidélité de ligature pour sélectionner de manière flexible des ensembles de sites de fusion haute fidélité pour l'assemblage Golden Gate (GGA), permettant l'assemblage précis et efficace de dizaines de pièces en une seule réaction et l'assemblage fiable de petits génomes jusqu'à 50 kb en un seul cycle d'assemblage. En utilisant cette approche, nous avons développé un assemblage modulaire en une seule étape de Escherichia coli phages T7 et Lambda, Pseudomonas aeruginosa phage ɸKMV, et Mycobacterium smegmatis Les phages BPs,. De petites parties (< 5 kB) propagées par plasmide supportent la mutagenèse via des méthodes de biologie moléculaire classiques et permettent des échanges de gènes entiers peu coûteux par substitution de nouvelles parties. Tous les systèmes sont récupérés directement par transformation dans l'hôte approprié avec un taux de réussite proche de 100% pour l'introduction de mutations souhaitées et < 1 mutation involontaire pour ~ 100 kb lorsque les fragments sont générés par PCR et < 1 pour 500 kb lorsque les parties sont des clones validés par séquence dans des plasmides. Ces systèmes sont appliqués à l'étude de la biologie, y compris le comportement de réplication et la gamme d'hôtes. Les systèmes ɸKMV et BPs représentent en outre des systèmes d'ingénierie modèles pour le développement de thérapies par phages ciblant les agents pathogènes humains multirésistants.